После нападения на «Крокус» было возбуждено несколько уголовных дел по статьям о террористическом акте, приготовлении к теракту, участии в деятельности террористической организации, незаконном обороте оружия и взрывчатых веществ. Кроме того, фигурантов дела обвиняют в участии в деятельности организации «Вилаят Хорасан»* (является частью ИГИЛ*). С перечисленными делами также было объединено в одно производстводело об оказании услуг, не отвечающих требованиям безопасности.
* Организация признана террористической, её деятельность запрещена на территории Российской Федерации.