В управление НИЦ может перейти семь научных учреждений. В их числе – Институт ядерных исследований РАН, ФНЦ пищевых систем имени Горбатова РАН, Всероссийский НИИ виноградарства и виноделия «Магарач» РАН, Северо-Кавказский ФНЦ садоводства, виноградарства, виноделия, Федеральный ростовский аграрный научный центр, Институт океанологии имени Ширшова РАН и Институт проблем технологии микроэлектроники и особочистых материалов РАН.