С 2006 по 2014 г. Сапунов был главой администрации Краснознаменска Московской области. Затем на год он стал главой городского округа Краснознаменск, с 2015 по 2017 г. занимал должность главы Красногорского муниципального района. С марта 2017 г. он был замдиректора департамента имущественных отношений Минобороны, а в сентябре 2020 г. его назначили директором департамента.